Коронавирус COVID-19, который впервые появился в 2019 году, продолжает мутировать, и на данный момент уже существует множество штаммов вируса SARS-CoV-2. Когда разные штаммы вызывают заболевание, они могут проходить по-разному и это вызывает много вопросов у медиков и обывателей. В этой статье рассмотрим основные вопросы о генетических вариантах коронавируса.

В микробиологии штаммы называются культурами, выделенными из одного источника, места и времени. Если культуры были выделены из одного источника, но в разное время, то они уже будут принадлежать к разным штаммам. Это понятие часто путают с видами, но микроорганизмы разных штаммов могут принадлежать к одному виду. Однако они все равно будут различаться между собой, но внутривидовые различия не играют большой роли. Коронавирус является ярким примером такой ситуации. Вирус SARS-CoV-2 - это всего лишь один из представителей многочисленного семейства коронавирусов, хотя и виновник последней пандемии COVID-19. За короткую историю пандемии сформировалось несколько штаммов SARS-CoV-2, которые отличаются между собой набором генов - геномом.

Важно знать, что все вирусы, включая SARS-CoV-2, являются не клетками. У них особая структура: вирусная частица (вирион) окружена капсулой и внешней оболочкой. Внутри капсулы находится одна или две молекулы нуклеиновой кислоты, которые являются генетической информацией. Коронавирус является одноцепочечным РНК-содержащим вирусом, геном которого закодирован в единственной молекуле рибонуклеиновой кислоты.

Формирование штаммов происходит благодаря генетическим мутациям, при которых образующиеся дочерние вирусы напоминают материнские, но имеют небольшие генетические отличия. Штаммы коронавируса могут отличаться по скорости распространения и клиническим проявлениям заболевания. Благодаря генетической изменчивости у коронавируса возникает устойчивость к иммунной системе и медикаментозным средствам.

В данной статье мы рассмотрели основные вопросы, связанные с штаммами коронавируса, их опасностью и мерами предосторожности.

Известно уже множество штаммов коронавируса SARS-Cov-2, каждый из них обозначается отдельной буквой греческого алфавита в соответствии с классификацией Всемирной организации здравоохранения. Первоначально штаммы ассоциировались с той страной, в которой они были обнаружены впервые. Например, британский штамм коронавируса был впервые выявлен в Великобритании и получил название "альфа", южноафриканский стал известен как "бета", бразильский - как "гамма", а индийский - как "дельта".

Однако географическая привязка к странам в названии штаммов может вызывать негативную реакцию и включать в обвинения в распространении COVID-19 целые страны. Поэтому ВОЗ предложила новую номенклатурную классификацию, основанную на греческом алфавите. Это не мешает использованию старых названий в медицинских исследованиях.

Но даже в новой классификации есть некоторые нюансы. Штамм коронавируса "омикрон" также получил название греческой буквы. Первоначально, перед ней должны были стоять буквы "ню" и "кси", однако их пропустили. Это связано со страхом вызвать панику у жителей англоязычных стран, если бы штамм назвали "новым", и с антикитайскими настроениями, связанными с ассоциацией буквы "кси" с китайской фамилией Си, которая носит лидер этой страны Си Цзиньпинь.

На начало 2022 года количество штаммов коронавируса, которые отличаются от первоначального, китайского варианта, составляет уже 13.

Вирусные штаммы COVID-19, которые считаются опасными, обладают определенными критериями. Во-первых, они характеризуются высокой контагиозностью, что означает их легкую передачу от человека к человеку. Во-вторых, это вирулентные штаммы, способные вызывать патологические изменения в тканях организма. Кроме того, они приводят к тяжелому течению инфекции, что сопровождается высокой вероятностью осложнений и неблагоприятного исхода болезни. Наконец, опасные штаммы коронавируса устойчивы к действию вакцин и лекарств. Все эти критерии использовались ВОЗ при разработке списка штаммов, вызывающих опасения, – VOC (Variants of Concern). В этот список вошли несколько штаммов, включая альфа-, бета-, гамма- и дельта-штаммы коронавируса. А 26 ноября 2021 года ВОЗ дополнила список новым штаммом омикрон. Также был разработан список генетических вариантов, вызывающих интерес – VOI (Variants of Interest). Если уровень заболеваемости этими вариантами возрастет, то их переведут в категорию VOC. В список VOI в 2021 году вошли несколько штаммов: эта-, йота-, каппа- и лямбда-штаммы.

Как проявляется COVID-19, вызванный дельта-штаммом, и в чем его отличие от классического коронавируса?

Дельта-штамм коронавируса, выявленный в Индии, имеет более короткий минимальный инкубационный период, чем классический коронавирус, изначально обнаруженный в городе Ухань. Максимальный период инкубации по-прежнему составляет две недели.

Помимо стандартных симптомов COVID-19, таких как кашель, лихорадка, потеря обоняния и вкуса, дельта-штамм вызывает симптомы, характерные для расстройства желудочно-кишечного тракта, такие как тошнота, рвота и диарея. При этом встречаются боли в голове и горле. Самой уязвимой группой при заражении дельта-штаммом является молодежь в возрасте от 14 до 29 лет.

Источник: Роспотребнадзор. 2021. "Дюжина вопросов о «дельта»-штамме". Доступно по ссылке.

Какова опасность дельта-штамма коронавируса?

Новая индийская вариация коронавируса отличается от классической своей высокой инфекционной способностью. Если в случае COVID-19 каждый пациент заражал от 2 до 3 человек, то в случае дельта-штамма этот показатель возрастает до 5-8. Привнесла ли новая форма изменения в клинический характер заболевания? Индивидуальные особенности клинического течения могут играть роль в увеличении количества заражений. Так, высокая температура часто предупреждает о заражении, но в случае дельта-штамма этот симптом может проявиться не сразу, что делает труднее обнаружить источник инфекции.

Количество вирусов в организме с штаммом дельта-плюс значительно выше по сравнению с классическим COVID-19, поэтому выработка антител требует больше времени и усилий. Усложняется лечение и резко растет вероятность госпитализации пациента. Штамм дельта плюс коронавируса, который является новой модификацией, особенно тяжело протекает и грозит значительным угрозам.

Что отличает британский вариант коронавируса от SARS-CoV-2?

Сравнительно с классическим китайским вариантом, симптомы британской коронавирусной инфекции проявляются чаще и с большей степенью выраженности. Например, боль в горле и кашель чаще отмечаются при альфа-штамме. Но утрата обоняния происходит реже - только у 39% пациентов.

Кроме того, вирус на 90% более заразен, а болезнь протекает более тяжело. Частота госпитализации в случае заражения альфа-штаммом выше на 64%, повышая риск неблагоприятного исхода.

Но к счастью, на территории РФ уровень заболеваемости британским штаммом не так высок. В целом, хочется отметить, что на сегодняшний день выделены несколько вариантов коронавируса - альфа, бета, гамма, дельта - и они отличаются друг от друга по структуре и способности заразить человека.

Что известно о новом штамме коронавируса омикрон?

В ноябре 2021 года был обнаружен новый южноафриканский штамм коронавируса, который вызвал большой рост заболеваемости во всем мире. Новая инфекция характеризуется высокой степенью заразности и каждый день устанавливает новые антирекорды. В отличие от предыдущих штаммов, которые преимущественно поражали пожилых людей и тех, у кого были сопутствующие заболевания, новый вирус может заражать даже детей.

В настоящее время нет единого мнения о том, насколько тяжело протекает заболевание и какова вероятность смертельного исхода. Согласно проведенным лабораторным исследованиям, омикрон-штамм реже проникает в легкие и вместо этого чаще поражает носоглотку. Это может быть одной из причин пиковой заболеваемости. Однако, количество смертей все еще находится на уровне от 0,1% до 0,2% и не выше, чем у предыдущих штаммов.

Дополнительную информацию о новом штамме коронавируса омикрон можно найти в статье биолога Константина Северинова "10 вопросов об омикрон-штамме", которую можно найти по ссылке: https://trends.rbc.ru/.

Как определить, заразился ли человек одним из вариантов коронавируса?

Характеристики каждого штамма вируса уникальны. Так, если человек заразился одним генетическим вариантом, то болезнь может протекать менее тяжело, в то время как при заражении другим вариантом болезнь может протекать в более тяжелой форме. Кроме того, некоторые типы коронавируса воздействуют в основном на пожилых людей, а другие - на людей всех возрастов. При заражении разными штаммами вируса может быть поражена легкие, носоглотка или желудочно-кишечный тракт. Однако, полагаться только на эти особенности штаммов коронавируса не стоит.

Для определения генетического варианта SARS-CoV-2 требуется проведение объективной диагностики и изучение вирусного генома в лабораторных условиях. В таком случае используют метод полимеразной цепной реакции (ПЦР) методом секвенирования, где определяется последовательность генов в молекулярной цепи. Хотя для этого требуется использование специализированного оборудования, а процедура является довольно простой: берется мазок из носоглотки и ротоглотки, которые могут быть взяты как в медицинском учреждении, так и дома. Результат готов уже через несколько часов, и они являются практически абсолютно достоверными. По этой причине метод ПЦР считается "золотым стандартом" диагностики инфекции COVID-19. Разработана также первая отечественная тест-система для секвенирования полного генома коронавируса SARS-CoV-2. Информационный портал о генетике GENETICS предоставляет к этому всю необходимую информацию. URL: https://genetics-info.ru/.

Вопрос о том, сохраняется ли иммунитет у человека после перенесенного коронавируса к другим его штаммам, остается открытым. После первого заражения в крови образуются антитела, которые пытаются уничтожить новые заражения. Однако возможно, что мутировавший коронавирус может плохо связываться с антителами, поэтому иммунная система может уничтожать не все, а лишь некоторые штаммы вируса.

Кроме того, временной фактор тоже имеет огромное значение. Со временем количество циркулирующих антител в крови уменьшается. Это означает, что эффективность защиты от последующих инфекций также может быть разной, в зависимости от времени, когда повторное заражение произошло, состояния иммунитета и вида мутации. В общем, ответ на вопрос о том, сохраняется ли иммунитет после перенесенного коронавируса, не является однозначным.

Фото: freepik.com